Article Dans Une Revue (Article De Synthèse) Mitochondrial medicine Année : 2021
A New Method for Sequencing the Mitochondrial Genome by Using Long Read Technology
Sophie Dhorne-Pollet (1) , Nicolas Pollet (2) , Eric Barrey (1)
1 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative (Domaine de Vilvert F-78252 Jouy-en-Josas - France)
"> GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
2 EGCE - Evolution, génomes, comportement et écologie (Avenue de la Terrasse, bâtiment 13, boite postale 1, 91198, Gif-sur-Yvette cedex - France)
"> EGCE - Evolution, génomes, comportement et écologie

Résumé

We describe a protocol to prepare a multiplexed mtDNA library from a blood sample for performing a long read sequencing of the mitochondrial genome. All steps are carefully described to get a high enrichment of mtDNA relative to total DNA extracted from the blood sample. The obtained mutiplexed library allows the production of long sequence mtDNA reads up to 16.5 kbp with a quality enabling variant-calling by using a portable sequencer (MinION, Oxford Nanopore Technologies).

Domaines

Sophie Pollet  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.inrae.fr/hal-04067200

Soumis le : jeudi 13 avril 2023-11:17:43

Dernière modification le : mercredi 10 septembre 2025-16:12:03

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-04067200 , version 1 (13-04-2023)
Identifiants

Citer

Sophie Dhorne-Pollet, Nicolas Pollet, Eric Barrey. A New Method for Sequencing the Mitochondrial Genome by Using Long Read Technology. Mitochondrial medicine, 2021, Methods in Molecular Biology, 2277, pp.331-343. ⟨10.1007/978-1-0716-1270-5_20⟩. ⟨hal-04067200⟩

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