2つアンインストールしても問題ありません。 現在使用しているバージョンの確認として、 「スタート」→「すべてのプログラム」→「アクセサリ」→「コマンド プロンプト」 でコマンドプロンプトを起動し、 java -version と入力すると現在使用しているJavaのバージョンが表示されます。 そこで表示されるバージョンが、 "1.6.0_07" なら Java(TM) 6 Update 7、 "1.6.0_05" なら Java(TM) 6 Update 5、 "1.6.0_02" なら Java(TM) 6 Update 2、 を使用していることになりますので、そのほかのバージョンは削除して問題ないということになります。