医科診療部門
- 検査部
- 手術部
- 放射線部
- 輸血部
- 高度救命救急センター
- 病理診断科
- 集中治療部
- 周産母子センター
- 内視鏡センター
- 透析内科
- 化学療法室
- がん治療センター
- 心不全センター
- スポーツ医科学センター
- 未来医療センター
- てんかんセンター
- 聴覚・人工聴覚機器センター
- IBDセンター（炎症性腸疾患センター）
- 漢方診療センター
- 国際リンパ浮腫治療センター
- 血友病診療センター
- アレルギーセンター
- 緩和ケアセンター
- 睡眠医療センター
- ゲノム医療センター
- メラノーマ治療センター
- 肝疾患センター
歯科診療部門
管理部門
- 医療情報部
- エイズ医療対策室
- 患者支援センター
- 医療安全管理部
- 感染制御部
- SPDセンター
- 外科系集中治療室
- ハイケア・ユニット
- 栄養管理部
- 栄養サポートチーム室
- 病歴管理センター
- 危機管理室
- 福島医療支援センター
- 女性医師支援センター
- 高難度新規医療技術審査部
- 未承認新規医薬品等審査部
- 肝疾患相談室
- 国際医療支援部
- 危機医療センター
- 脳卒中・心臓病等総合支援センター